$HGP$ में किन पद्धतियों का उपयोग किया गया था?

(N/A) इन पद्धतियों में दो मुख्य दृष्टिकोण शामिल थे:
$1$. एक्सप्रेस्ड सीक्वेंस टैग्स $(ESTs)$: यह दृष्टिकोण उन सभी जीनों की पहचान करने पर केंद्रित था जो $RNA$ के रूप में व्यक्त होते हैं।
$2$. सीक्वेंस एनोटेशन: इस दृष्टिकोण में पूरे जीनोम का अनुक्रमण (sequencing) करना शामिल था,जिसमें सभी कोडिंग और नॉन-कोडिंग अनुक्रम शामिल थे,और बाद में अनुक्रम के विभिन्न क्षेत्रों को कार्य सौंपना था।
अनुक्रमण के लिए,एक कोशिका से कुल $DNA$ को अलग किया जाता है और अपेक्षाकृत छोटे आकार के यादृच्छिक टुकड़ों में परिवर्तित किया जाता है और विशेष वैक्टर का उपयोग करके उपयुक्त मेजबान (host) में क्लोन किया जाता है। क्लोनिंग के परिणामस्वरूप प्रत्येक $DNA$ टुकड़े का प्रवर्धन (amplification) हुआ ताकि इसे आसानी से अनुक्रमित किया जा सके। आमतौर पर उपयोग किए जाने वाले मेजबान बैक्टीरिया और यीस्ट थे,और वैक्टर को $BAC$ (बैक्टीरियल आर्टिफिशियल क्रोमोसोम) और $YAC$ (यीस्ट आर्टिफिशियल क्रोमोसोम) कहा जाता था।
टुकड़ों को स्वचालित $DNA$ अनुक्रमकों का उपयोग करके अनुक्रमित किया गया था जो फ्रेडरिक सेंगर द्वारा विकसित एक विधि के सिद्धांत पर काम करते थे। इन अनुक्रमों को फिर उनमें मौजूद कुछ ओवरलैपिंग क्षेत्रों के आधार पर व्यवस्थित किया गया। चूंकि इन अनुक्रमों का संरेखण (alignment) मानवीय रूप से संभव नहीं था,इसलिए विशेष कंप्यूटर-आधारित प्रोग्राम विकसित किए गए। इन अनुक्रमों को बाद में एनोटेट किया गया और प्रत्येक गुणसूत्र को सौंपा गया। गुणसूत्र $1$ का अनुक्रम मई $2006$ में पूरा हुआ था (यह अनुक्रमित होने वाला $24$ मानव गुणसूत्रों में से अंतिम था)।
एक और चुनौतीपूर्ण कार्य जीनोम पर आनुवंशिक और भौतिक मानचित्रों को सौंपना था। यह रिस्ट्रिक्शन एंडोन्यूक्लिएज रिकग्निशन साइट्स के बहुरूपता (polymorphism) और माइक्रोसेटेलाइट्स के रूप में जानी जाने वाली कुछ दोहराव वाली $DNA$ अनुक्रमों की जानकारी का उपयोग करके उत्पन्न किया गया था।