(N/A) क्षार युग्मन (base pairing) पॉलिन्यूक्लियोटाइड श्रृंखलाओं को एक विशिष्ट गुण प्रदान करता है।
दोनों पॉलिन्यूक्लियोटाइड श्रृंखलाएं एक-दूसरे की पूरक होती हैं। इसलिए,यदि एक श्रृंखला में क्षारों का क्रम ज्ञात हो,तो दूसरी श्रृंखला में क्षारों के क्रम का अनुमान लगाया जा सकता है।
यदि $DNA$ (जनक $DNA$) की प्रत्येक श्रृंखला एक नई श्रृंखला के संश्लेषण के लिए एक टेम्पलेट के रूप में कार्य करती है,तो उत्पन्न होने वाले दो द्वि-कुंडली $DNA$ अणु (संतति $DNA$) जनक $DNA$ अणु के समान होते हैं।
$DNA$ की द्वि-कुंडली संरचना की मुख्य विशेषताएं इस प्रकार हैं:
$(1)$ $DNA$ दो पॉलिन्यूक्लियोटाइड श्रृंखलाओं से बना होता है। इसका आधार शर्करा-फॉस्फेट से बना होता है और नाइट्रोजनस क्षार अंदर की ओर होते हैं।
$(2)$ दोनों श्रृंखलाओं की ध्रुवता प्रति-समांतर (anti-parallel) होती है। इसका अर्थ है कि यदि एक श्रृंखला की ध्रुवता $5' \rightarrow 3'$ है,तो दूसरी की $3' \rightarrow 5'$ होती है।
$(3)$ दोनों श्रृंखलाओं के नाइट्रोजनस क्षार हाइड्रोजन बंधों के माध्यम से जुड़कर क्षार युग्म बनाते हैं। एडेनिन विपरीत श्रृंखला के थाइमिन के साथ दो हाइड्रोजन बंधों द्वारा जुड़ता है और इसके विपरीत। इसी प्रकार,ग्वानिन तीन हाइड्रोजन बंधों द्वारा साइटोसिन के साथ जुड़ता है।
$A = T, G \equiv C$
इसके परिणामस्वरूप दोनों श्रृंखलाओं के बीच समान दूरी बनी रहती है।
$(4)$ दोनों श्रृंखलाएं दाहिने हाथ की ओर (right-handed) कुंडलित होती हैं। कुंडली का पिच $3.4 \ nm$ (एक नैनोमीटर यानी $10^{-9} \ m$) है और प्रत्येक मोड़ में लगभग $10 \ bp$ होते हैं। परिणामस्वरूप,एक कुंडली में दो क्रमिक क्षार युग्मों के बीच की दूरी लगभग $0.34 \ nm$ होती है।