मानव जीनोम के अनुक्रमण (sequencing) में उपयोग की जाने वाली विधियों का विवरण दीजिए।

(N/A) कार्यप्रणाली: इन विधियों में दो मुख्य दृष्टिकोण शामिल थे।
$1$. एक्सप्रेस्ड सीक्वेंस टैग्स $(ESTs)$: एक दृष्टिकोण उन सभी जीनों की पहचान करने पर केंद्रित था जो $RNA$ के रूप में व्यक्त होते हैं।
$2$. सीक्वेंस एनोटेशन: दूसरा दृष्टिकोण अंधाधुंध था,जिसमें जीनोम के पूरे सेट का अनुक्रमण किया गया जिसमें सभी कोडिंग और नॉन-कोडिंग अनुक्रम शामिल थे,और बाद में अनुक्रम के विभिन्न क्षेत्रों को कार्य सौंपे गए।
अनुक्रमण के लिए,एक कोशिका से कुल $DNA$ को अलग किया जाता है और अपेक्षाकृत छोटे आकार के यादृच्छिक टुकड़ों में परिवर्तित किया जाता है (क्योंकि $DNA$ एक बहुत लंबा बहुलक है,और $DNA$ के बहुत लंबे टुकड़ों के अनुक्रमण में तकनीकी सीमाएं हैं) और विशेष वैक्टर का उपयोग करके उपयुक्त मेजबान में क्लोन किया जाता है।
क्लोनिंग के परिणामस्वरूप प्रत्येक $DNA$ टुकड़े का प्रवर्धन (amplification) हुआ ताकि इसे बाद में आसानी से अनुक्रमित किया जा सके। आमतौर पर उपयोग किए जाने वाले मेजबान बैक्टीरिया और खमीर (yeast) थे,और वैक्टर को $BAC$ (बैक्टीरियल आर्टिफिशियल क्रोमोसोम) और $YAC$ (यीस्ट आर्टिफिशियल क्रोमोसोम) कहा जाता था।
इन टुकड़ों को स्वचालित $DNA$ अनुक्रमकों का उपयोग करके अनुक्रमित किया गया था जो फ्रेडरिक सेंगर द्वारा विकसित एक विधि के सिद्धांत पर काम करते थे। इन अनुक्रमों को फिर उनमें मौजूद कुछ ओवरलैपिंग क्षेत्रों के आधार पर व्यवस्थित किया गया। इसके लिए अनुक्रमण हेतु ओवरलैपिंग टुकड़ों के निर्माण की आवश्यकता थी। इन अनुक्रमों का संरेखण (Alignment) मानवीय रूप से संभव नहीं था,इसलिए,विशेष कंप्यूटर-आधारित प्रोग्राम विकसित किए गए। इन अनुक्रमों को बाद में एनोटेट किया गया और प्रत्येक गुणसूत्र को सौंपा गया। एक और चुनौतीपूर्ण कार्य जीनोम पर आनुवंशिक और भौतिक मानचित्रों को सौंपना था। यह जानकारी रिस्ट्रिक्शन एंडोन्यूक्लिज रिकग्निशन साइट्स के बहुरूपता (polymorphism) और माइक्रोसेटेलाइट्स के रूप में जानी जाने वाली कुछ दोहरावदार $DNA$ अनुक्रमों का उपयोग करके उत्पन्न की गई थी।