(N/A) $ \Rightarrow $ शारीरिक $ pH $ पर, अमोनिया प्रोटोनित होकर $ NH_{4}^{+} $ आयन बनाती है।
$ \Rightarrow $ अधिकांश पादप नाइट्रेट और अमोनियम आयनों दोनों को आत्मसात कर सकते हैं, लेकिन अमोनियम आयन पादपों के लिए काफी विषाक्त होते हैं और इसलिए उनमें जमा नहीं हो सकते।
$ \Rightarrow $ पादपों में $ NH_{4}^{+} $ का उपयोग अमीनो अम्ल के संश्लेषण के लिए दो मुख्य प्रक्रियाओं द्वारा किया जाता है: $ (i) $ अपचयात्मक एमिनेशन (Reductive Amination) और $ (ii) $ ट्रांसएमिनेशन (Transamination)।
$ (i) $ अपचयात्मक एमिनेशन: इस प्रक्रिया में, अमोनिया $ \alpha $-कीटोग्लूटारिक अम्ल के साथ अभिक्रिया करके ग्लूटामिक अम्ल बनाती है:
$ \alpha $-कीटोग्लूटारिक अम्ल $ + NH_{4}^{+} + NADPH \xrightarrow{\text{ग्लूटामेट डीहाइड्रोजिनेज}} \text{ग्लूटामेट} + H_{2}O + NADP $
$ (ii) $ ट्रांसएमिनेशन: इसमें एक अमीनो अम्ल से अमीनो समूह का कीटो अम्ल के कीटो समूह में स्थानांतरण शामिल है। ग्लूटामिक अम्ल मुख्य अमीनो अम्ल है जिससे अमीनो समूह $ (NH_{2}) $ अन्य अमीनो अम्लों के निर्माण के लिए स्थानांतरित होता है। ट्रांसएमिनेज एंजाइम इन अभिक्रियाओं को उत्प्रेरित करता है।
$ \text{अमीनो-दाता} + \text{अमीनो-ग्राही} \xrightarrow{\text{ट्रांसएमिनेज}} \text{कीटो-अम्ल} + \text{नया अमीनो अम्ल} $
$ \Rightarrow $ इसके अतिरिक्त, दो महत्वपूर्ण एमाइड्स, एस्पाराजीन और ग्लूटामिन, एस्पार्टिक अम्ल और ग्लूटामिक अम्ल में एक और अमीनो समूह जोड़कर बनते हैं। चूंकि एमाइड्स में नाइट्रोजन अधिक होता है, इसलिए उन्हें जाइलम वाहिकाओं के माध्यम से ले जाया जाता है। कुछ पादप (जैसे सोयाबीन) स्थिर नाइट्रोजन को यूराइड्स के रूप में भी निर्यात करते हैं।