(N/A) $ \Rightarrow $ શારીરિક $pH$ પર, એમોનિયા પ્રોટોનેટેડ થઈને $NH_{4}^{+}$ આયન બનાવે છે.
$ \Rightarrow $ મોટાભાગની વનસ્પતિઓ નાઈટ્રેટ અને એમોનિયમ આયનો બંનેનું સ્વાંગીકરણ કરી શકે છે, પરંતુ એમોનિયમ આયન વનસ્પતિઓ માટે અત્યંત ઝેરી હોવાથી તેમાં સંગ્રહિત થઈ શકતા નથી.
$ \Rightarrow $ વનસ્પતિઓમાં એમિનો એસિડના સંશ્લેષણ માટે $NH_{4}^{+}$ નો ઉપયોગ બે મુખ્ય પ્રક્રિયાઓ દ્વારા થાય છે: $(i)$ રિડક્ટિવ એમીનેશન અને $(ii)$ ટ્રાન્સએમીનેશન.
$(i)$ રિડક્ટિવ એમીનેશન: આ પ્રક્રિયામાં, એમોનિયા $\alpha$-કીટોગ્લુટેરિક એસિડ સાથે પ્રતિક્રિયા કરીને ગ્લુટેમિક એસિડ બનાવે છે:
$\alpha$-કીટોગ્લુટેરિક એસિડ $+ NH_{4}^{+} + NADPH \xrightarrow{\text{Glutamate Dehydrogenase}} \text{Glutamate} + H_{2}O + NADP$
$(ii)$ ટ્રાન્સએમીનેશન: આમાં એક એમિનો એસિડમાંથી એમિનો જૂથનું કીટો એસિડના કીટો જૂથમાં સ્થાનાંતરણ થાય છે. ગ્લુટેમિક એસિડ એ મુખ્ય એમિનો એસિડ છે જેમાંથી એમિનો જૂથ $(-NH_{2})$ અન્ય એમિનો એસિડ બનાવવા માટે સ્થાનાંતરિત થાય છે. ટ્રાન્સએમિનેઝ ઉત્સેચક આ પ્રતિક્રિયાઓને ઉદ્દીપિત કરે છે.
$ \Rightarrow $ બે સૌથી મહત્વપૂર્ણ એમાઈડ્સ, એસ્પરાજીન અને ગ્લુટામાઈન, પ્રોટીનનો બંધારણીય ભાગ છે. તે અનુક્રમે એસ્પાર્ટિક એસિડ અને ગ્લુટેમિક એસિડમાં અન્ય એમિનો જૂથ ઉમેરીને બનાવવામાં આવે છે. એમાઈડ્સમાં એમિનો એસિડ કરતા વધુ નાઈટ્રોજન હોવાથી, તેઓ જલવાહક પેશી (xylem) દ્વારા વનસ્પતિના અન્ય ભાગોમાં વહન પામે છે.
$ \Rightarrow $ વધુમાં, કેટલીક વનસ્પતિઓની મૂળગંડિકાઓ (દા.ત. સોયાબીન) સ્થિર નાઈટ્રોજનને યુરાઈડ્સ તરીકે નિકાસ કરે છે, જે નાઈટ્રોજન અને કાર્બનનો ઊંચો ગુણોત્તર ધરાવે છે.