(N/A) क्षार युग्मन (base pairing) पॉलीन्यूक्लियोटाइड श्रृंखलाओं को एक बहुत ही विशिष्ट गुण प्रदान करता है।
वे एक-दूसरे के पूरक (complementary) कहलाते हैं और इसलिए,यदि एक रज्जुक में क्षारों का अनुक्रम ज्ञात हो,तो दूसरे रज्जुक में अनुक्रम की भविष्यवाणी की जा सकती है।
साथ ही,यदि $DNA$ का प्रत्येक रज्जुक एक नए रज्जुक के संश्लेषण के लिए सांचे (template) के रूप में कार्य करता है,तो इस प्रकार उत्पन्न दो द्विरज्जुक $DNA$ (संतति $DNA$) जनक $DNA$ अणु के समान होंगे। इस कारण से,$DNA$ की संरचना के आनुवंशिक निहितार्थ बहुत स्पष्ट हो जाते हैं।
$DNA$ की द्विकुंडलित संरचना की मुख्य विशेषताएं इस प्रकार हैं:
$(i)$ यह दो पॉलीन्यूक्लियोटाइड श्रृंखलाओं से बना है जहाँ आधार (backbone) शर्करा-फॉस्फेट द्वारा निर्मित होता है और क्षार अंदर की ओर प्रक्षेपित होते हैं।
$(ii)$ दोनों श्रृंखलाओं की ध्रुवता प्रति-समांतर (anti-parallel) होती है। इसका अर्थ है,यदि एक श्रृंखला की ध्रुवता $5^{\prime} \rightarrow 3^{\prime}$ है,तो दूसरी की $3^{\prime} \rightarrow 5^{\prime}$ होती है।
$(iii)$ दो रज्जुक में क्षार हाइड्रोजन बंधों ($H$-bonds) के माध्यम से जुड़कर क्षार युग्म $[bp]$ बनाते हैं। एडेनिन $(A)$ विपरीत रज्जुक के थाइमिन $(T)$ के साथ दो हाइड्रोजन बंध बनाता है और इसके विपरीत,जबकि ग्वानिन $(G)$ साइटोसिन $(C)$ के साथ तीन हाइड्रोजन बंध बनाता है और इसके विपरीत।