(D) દ્વિ-સૃષ્ટિ વર્ગીકરણ પદ્ધતિ લાંબા સમય સુધી સ્વીકારવામાં આવી હતી,પરંતુ તેની ઘણી મર્યાદાઓ હતી:
$(i)$ તે આદિકોષકેન્દ્રી (જેમ કે બેક્ટેરિયા) અને સુકોષકેન્દ્રી સજીવો વચ્ચે ભેદ પાડવામાં નિષ્ફળ રહી.
$(ii)$ તે એકકોષી અને બહુકોષી સજીવો વચ્ચે તફાવત કરી શકી નહીં.
$(iii)$ તે પ્રકાશસંશ્લેષી (લીલ) અને અપ્રકાશસંશ્લેષી (ફૂગ) સજીવો વચ્ચે ભેદ પાડવામાં નિષ્ફળ રહી.
$(iv)$ ફૂગની કોષદીવાલ કાઈટિનની બનેલી હોય છે,જે વનસ્પતિની સેલ્યુલોઝની બનેલી કોષદીવાલ કરતા રાસાયણિક રીતે અલગ છે.
$(v)$ યુગ્લીના જેવા સજીવો વનસ્પતિ (પ્રકાશસંશ્લેષી) અને પ્રાણી (પરપોષી) બંને જેવા લક્ષણો ધરાવે છે,જેના કારણે તેમનું વર્ગીકરણ મુશ્કેલ બન્યું.
$(vi)$ લાઈકેન,જે લીલ અને ફૂગનું સહજીવન છે,તેને કોઈ પણ સૃષ્ટિમાં મૂકી શકાયા નહીં.
$(vii)$ વાયરસ,જેમાં કોષીય તંત્ર અને જીવરસનો અભાવ હોય છે,તે આ પદ્ધતિમાં બંધબેસતા નથી કારણ કે તેઓ સંપૂર્ણપણે જીવંત કે નિર્જીવ નથી.