$RNA$ की सहायता से जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित किया जा सकता है। इस विधि को एक उदाहरण के साथ समझाइए।

(A) कई सूत्रकृमि (nematodes) मनुष्यों सहित पौधों और जानवरों की एक विस्तृत विविधता पर परजीवी के रूप में रहते हैं। $Meloidogyne \text{ } incognitia$ नामक एक सूत्रकृमि तंबाकू के पौधों की जड़ों को संक्रमित करता है और पैदावार में भारी कमी लाता है।
इस संक्रमण को रोकने के लिए एक नई रणनीति अपनाई गई,जो $RNA$ इंटरफेरेंस $(RNAi)$ की प्रक्रिया पर आधारित थी।
$RNAi$ कोशिकीय रक्षा की एक विधि के रूप में सभी यूकेरियोटिक जीवों में होता है। इस विधि में एक विशिष्ट $mRNA$ का साइलेंसिंग (silencing) शामिल है,जो एक पूरक $dsRNA$ अणु के कारण होता है जो $mRNA$ से जुड़ता है और उसके अनुवाद (translation) को रोकता है।
इस पूरक $RNA$ का स्रोत $RNA$ जीनोम वाले वायरस का संक्रमण या मोबाइल जेनेटिक तत्व (ट्रांसपोसोन) हो सकते हैं जो $RNA$ मध्यवर्ती के माध्यम से प्रतिकृति बनाते हैं।
$Agrobacterium$ वैक्टर का उपयोग करके,सूत्रकृमि-विशिष्ट जीन को मेजबान पौधे में पेश किया गया था। $DNA$ का प्रवेश इस तरह से किया गया था कि इसने मेजबान कोशिकाओं में सेंस और एंटी-सेंस दोनों $RNA$ का उत्पादन किया।
ये दो $RNA$ अणु,एक-दूसरे के पूरक होने के कारण,एक डबल-स्ट्रैंडेड $RNA$ $(dsRNA)$ बनाते हैं जिसने $RNAi$ को शुरू किया और इस प्रकार,सूत्रकृमि के विशिष्ट $mRNA$ को साइलेंस कर दिया। परिणाम यह हुआ कि परजीवी विशिष्ट इंटरफेरिंग $RNA$ व्यक्त करने वाले ट्रांसजेनिक मेजबान में जीवित नहीं रह सका। इसलिए,ट्रांसजेनिक पौधा परजीवी से सुरक्षित हो गया।